微生物检验是对部份产品（主要直接入口的食品）细菌污染的定性或定量检验。
检测范围：
水质：生活饮用水、天然矿泉水、纯净水、天然净水、瓶桶装饮用水及工业用水等。
食品：内制品、水产制品、蛋制品、粮食制品、乳制品、饮料等。
医药：药品、药品原料、中药材、保健品等。
日用产品：化妆品、清洁护理用品、洗涤用品、一次性卫生用品、一次性医用品等。
工业制品：纺织品材料及制品、陶瓷及制品、塑料及制品、电工电子产品等。
常规项目:
菌落总数、大肠菌群、大肠杆菌、霉菌、酵母菌等；
致病菌:
沙门氏菌、单核增生李斯特氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、霍乱弧菌、创伤弧菌、弯曲杆菌属、阪崎肠杆菌、绿脓杆菌、溶血性链球菌、肉毒梭菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽孢杆菌、大肠埃希氏O157：H7/NM、致泻大肠埃希氏菌、溶藻弧菌等；
其他:
军团菌、乳酸菌、罐头食品的商业无菌、肠杆菌科、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、肠杆菌属、厌氧菌落总数、厌氧亚硫酸盐还原菌、需氧嗜温菌芽孢、厌氧嗜温菌芽孢、嗜热嗜酸菌、嗜热菌落总数、白色念珠菌等；
实时PCR快速检测:
沙门氏菌、单核增生李斯特菌、大肠杆菌O157:H7/NM；
抗菌性测试:
塑料制品，陶瓷，其他抗菌材质；
药典常规测试:
USP 62，Ch。
